تستخدم أنظمة الضخ الشمسية التي تقوم بضخ الماء من الآبار العميقة أو الحفر المضخات الغاطسة التي يتم تركيبها في البئر أو الحفرة. وتعتبر عالية الكفاءة وقوية ومتينة، وتتطلب صيانة قليلة جدًا.
وتُستخدم أنواع الأنظمة هذه لتوفير المياه للاستهلاك البشري أو إمدادات المياه للماشية. ويمكن أيضًا استخدام المياه التي يتم ضخها في الري، اعتمادًا على متطلبات المياه وقيمة المحاصيل.
نظام مضخات المياه الشمسية مع مضخة غاطسة تحت الماء في حفرة أو بئر.
يتمثل الجزء الأكبر من التكلفة في الحفر وتحضير البئر أو الحفرة (إذا لم يكن البئر موجودًا بالفعل). يتطلب الأمر المعرفة بعلم المياه عند تصميم وحساب حجم أنظمة الضخ الشمسية لمضخات الحفر الكبيرة، لذا يوصى بشراء الأنظمة من الشركات المتخصصة في هذا المجال.